в магазине сейчас отображаются все категории и подкатегории товаров в меню, нужно показывать только подкатегории активной категории, а остальные скрыты.

Можно сделать с помощью jquery и изменения в файле

ксс:
.bnav ul {display:none}

Скрипт (.bnav это название блока ul в котором содержится список генерируемый системой):
//Block category
$(function(){
        $(".bnav span").parents('ul').css('display','block');
        $(".bnav span").parents('ul').parents('ul').css('display','block');
        $(".bnav span").next().css('display','block');
});

Далее:
application\modules\shop\classes\SCategoryTree.php
ищем: echo '<li>'.ShopCore::encode($key->getName()).'</a>';
заменяем на: echo '<li><span>'.ShopCore::encode($key->getName()).'</span>';
Делаем добро для нашего скрипта и убиваем ошибку разработчиков , забыли закрывающий тег </a> убрать

Пример где можно глянуть отправил в ЛС.

Знаю, что реализация не самая лучшая, конечно бы лучше было на стороне сервера это делать, но ...